Stepana Banderę władze niemieckie zatrzymały w lipcu 1941 r. We wrześniu tegoż roku zostaje osadzony w więzieniu w Berlinie, skąd po jakimś czasie przeniesiono go do obozu Sachsenhausen. W tym samym obozie w tym samym czasie i w takich samych warunkach był więziony pierwszy dowódca AK Stefan "Grot"-Rowecki.
Banderę wypuszczono z niemieckiego obozu jesienią 1944 roku. Czystki etniczne na Wołyniu miały miejsce od początku 1943 r. do początku 1944 roku. Nie ma dowodów na to, że przebywając w obozie koncentracyjnym Sachsenhausen Bandera był w stanie utrzymywać kontakty z bojówkami ukraińskimi działającymi na Wołyniu. Wielu z przywódców jego odłamu Organizacji Ukraińskich Nacjonalistów od drugiej połowy 1941 roku przebywało w niemieckich więzieniach, obozach koncentracyjnych lub obozach zagłady. Według materiałów Sądu z Norymbergii władze hitlerowskie wydały rozkaz zabijania członków OUN Bandery bez postępowania sądowego.Po wojnie Stepan Bandera nie wrócił do Galicji i prowadził działalność polityczną na emigracji. W 1959 r. został zamordowany w Monachium przez sowieckiego agenta.
Wasyl Bandera, brat Stepana, został aresztowany przez Niemców w Stanisławowie w grudniu 1941 roku. Następnie osadzono go w niemieckim obozie koncentracyjnym w Oświęcimiu, gdzie wkrótce zginął.
Dr Aleksander Bandera, brat Stepana, został aresztowany przez Gestapo w 1941 roku we Lwowie. W lipcu 1942 roku przewieziono go do Oświęcimia, gdzie go wkrótce zakatowano. Według niektórych źródeł obu braci Banderów zamordowali polscy kapo.
o. Andrij Bandera, ojciec Stepana, proboszcz katolicki obrządku wschodniego. W 1928 r. aresztowały go władze polskie pod zarzutem m. in. odprawienia mszy za żołnierzy Ukraińskiej Armii Galicyjskiej, lecz z powodu braku dowodów został zwolniony. W maju 1941 został aresztowany przez NKWD pod zarzutem utrzymywania kontaktów z synem. Na początku lipca tegoż roku skazano go na śmierć i prawdopodobnie rozstrzelano lub zakatowano w trakcie masowych mordów na więźniach politycznych przed opuszczeniem Kijowa przez Sowiety.
Siostry Stepana Bandery, Martę i Oksanę, władze sowieckie zesłały na Syberię w 1941 r. Martą umarła na Syberii, a Oksanie zezwolono powrócić dopiero w 1989 roku. Siostrę Włodzimierę zesłano do sowieckich łagrów na Syberii w 1946 r., zwolniono w 1956 r.
o. Wasyl Oparowski, ojciec żony Stepana Bandery - Jarosławy, ksiądz katolicki obrządku wschodniego, kapelan Ukraińskiej Armii Galicyjskiej, zginął w wojnie polsko-ukraińskiej w 1919 roku.
